Η Πτυχιακή ή Διπλωματική Εργασία αποτελεί απαραίτητη προϋπόθεση για την απόκτηση πτυχίου στα περισσότερα Τμήματα του Πανεπιστημίου Αιγαίου. Η εργασία αυτή εκτελείται κατά τη διάρκεια του τελευταίου εξαμήνου σπουδών. To θέμα της εργασίας επιλέγεται σε συνεργασία με ένα διδάσκοντα του Τμήματος, ο οποίος είναι και ο επιβλέπων καθηγητής. Μετά την ολοκλήρωση και συγγραφή της εργασίας, ο φοιτητής την υποστηρίζει ενώπιον τριμελούς εξεταστικής επιτροπής η οποία αποτελείται από διδάσκοντες σχετικών με το θέμα της εργασίας γνωστικών αντικειμένων. Η τριμελής αυτή επιτροπή είναι υπεύθυνη και για τη βαθμολόγηση της Διπλωματικής Εργασίας.